لضمان إنجاز المشاريع في الآجال المحددة وبالكلفة المحددة لها مع إحترام المواصفات التقنية المطلوبة، تم إحداث عشرة فروع جهوية للصندوق:
- الفرع الجهوي بباجة يغطي ولايات باجة وجندوبة.
- الفرع الجهوي بقفصة يغطي ولايات قفصة وقبلي وتوزر.
- الفرع الجهوي بسوسة يغطي ولايات سوسة والمنستير.
- الفرع الجهوي بصفاقس يغطي ولايتي صفاقس وقابس.
- الفرع الجهوي بتونس يغطي ولايات تونس وبن عروس وأريانة ومنوبة وبنزرت.
- الفرع الجهوي بنابل يغطي ولايتي زغوان ونابل.
- الفرع الجهوي بمدنين يغطي ولايتي مدنين وتطاوين.
- الفرع الجهوي بالكاف يغطي ولايتي الكاف وسليانة.
- الفرع الجهوي بسيدي بوزيد يغطي ولايتي سيدي بوزيد والقصرين.
- الفرع الجهوي بالقيروان يغطي ولايتي القيروان والمهدية .
وتتولى هذه الفروع مساعدة البلديات والمجالس الجهوية على :
- ترشيد استثماراتها
- إعـداد ملفات طلب التمويل وتحويل الإعتمادات.
- الرفع من نسق إستهلاك الإعتمادات وتحسين آجال الإنجاز.
- المتابعة الميدانية لسير المشاريع في الجهة التي ترجع لها بالنظر.
- الإحاطة الفنية والمالية بالبلديات.
